I och med kommunalvalet i juni 2021 byttes HUS styrelse. Den nya styrelsen valdes vid fullmäktigemötet 14.10.2021. Den nya styrelsen sammanträdde första gången 25.10.2021.
HUS leds av en styrelse som lyder under fullmäktige och som fullmäktige utser för sin mandatperiod. Dessutom utser Helsingfors universitet två styrelseledamöter. Styrelsen fokuserar i synnerhet på att uppnå sjukvårdsdistriktets strategiska mål och att upprätthålla balansen i ekonomin.